В Digimon World: Next Order вам предстоит играть за Такуто, выпускника старшей школы, либо за девушку по имени Шики. Такуто в юности был большим поклонником Дигимонов, даже занял второе место в национальном турнире, но после больше стал задаваться вопросом о своем будущем. Герои отправляются в Цифровой Мир, где встречают своих Дигимонов, а также других персонажей.